Análisis transcriptómico en la influencia de la microalga chlorella sp. durante la germinación de arabidopsis thaliana en muestras de agua del río tambo contaminadas con As y B

Detalles del proyecto

Descripción

Evaluar el número de genes transcritos en la influencia de la microalga Chlorella sp. durante la germinación de Arabidopsis thaliana en muestras de agua del río Tambo contaminadas con As y B.

Descripción de Layman

Según los últimos reportes en la Región Arequipa, mencionan que las aguas del río Tambo están contaminadas con arsénico y boro. La ecotoxicología del arsénico inorgánico causa la disminución en la producción de glóbulos rojos y blancos, incluso puede dañar el ADN. La exposición del Arsénico orgánico causa lesión de nervios y dolores de estómago. Entre los efectos ambientales del boro, en los humanos infectan el estómago, hígado, riñones, cerebro y eventualmente llevan a la muerte. Los análisis transcriptómicos del RNA-seq se han realizado en algas marinas y transcriptomas vegetales. El RNA-seq es una herramienta transcriptómica actual que está fundamentada en la secuenciación de ADNc basada en los desarrollos NGS. Uno de los pasos fundamentales en la trancriptómica es la obtención final de un ARN de buena calidad que represente la condición final del organismo de estudio. El presente proyecto está enfocado en usar “Análisis transcriptómico en la influencia de la microalga Chlorella sp. durante la germinación de Arabidopsis thaliana en muestras de agua del río Tambo contaminadas con As y B”. Se usará la microalga Chlorella sp. porque es un organismo cosmopolita y se usará Arabidopsis thaliana porque es conocido molecularmente su genoma al 100%. Se realizará la obtención de cultivos líquidos axénicos de Chlorella sp. para sembrar Arabidopsis thaliana, seguido de la evaluación de los distintos tratamientos con los metales pesados (As y B) de aguas obtenidas del río Tambo, la siguiente etapa será la determinación de la eficiencia fotosintética en respuestas transcriptómicas de Arabidopsis thaliana en los tratamientos de aguas contaminadas obtenidas del río Tambo. Por último, se hará uso de la técnica RNA-seq en tiempo real para evaluar las respuestas transcriptómicas de genes de Arabidopsis thaliana obtenidos de tratamientos de muestras de aguas contaminadas del río Tambo,
orientando de tal forma a solucionar problemas en el sector salud incontrolables, proporcionando una alternativa de predictibilidad multidisciplinaria en sectores poblados arequipeños afectadas por la explotación minera, relacionado a enfermedades en metales pesados, mediante estudios de genómica molecular.

Hallazgos clave

Transcriptómica, Chlorella, Arabidopsis thaliana, arsénico, boro, estrés, RNA-seq, PCR, bioinformática, UNSA, Arequipa
EstadoActivo
Fecha de inicio/Fecha fin1/04/21 → …